Καθήκοντα Πρύτανη του Πανεπιστημίου Αιγαίου θα ασκεί από την 1^η Ιουλίου 2023  και έως την ολοκλήρωση της διαδικασίας ανάδειξης του Πρύτανη και των Αντιπρυτάνεων, ο Καθηγητής του Τμήματος Περιβάλλοντος Ανδρέας Τρούμπης επειδή είναι το αρχαιότερο μέλος ΔΕΠ από τα έξι εσωτερικά μέλη του Συμβουλίου Διοίκησης.

Το αμέσως επόμενο αρχαιότερο μέλος ΔΕΠ του Συμβουλίου Διοίκησης, ο καθηγητής του Τμήματος Μαθηματικών Κωνσταντίνος Χουσιάδας θα αναπληρώνει τον  Καθηγητή Ανδρέα Τρούμπη σε περίπτωση απουσίας ή κωλύματος.

Ας σημειωθεί ότι μετά τη συγκρότηση του Συμβουλίου Διοίκησης του Πανεπιστημίου Αιγαίου εκδόθηκε η Πρόσκληση Εκδήλωσης Ενδιαφέροντος υποβολής υποψηφιοτήτων για το αξίωμα του/της Πρύτανη/Πρυτάνισσας του Πανεπιστημίου Αιγαίου σύμφωνα με την οποία η προθεσμία υποβολής υποψηφιοτήτων λήγει στις 10/07/2023. Η ανάδειξη νέου Πρύτανη αναμένεται να έχει ολοκληρωθεί έως το τέλος Ιουλίου.